GE_AKTA Pilot蛋白純化儀廣泛應用于生物化學研究應用領域，是重要的操作技術。典型的真核細胞含有數千種不同的蛋白質，有些很豐富，有些只包含幾個拷貝。要研究某種蛋白質，必須先從其他蛋白質和非蛋白質分子中純化出該蛋白質。
蛋白純化儀利用顆粒不同程度的顆粒吸附力來使分離的目的達到蛋白質的選擇吸附分離。蛋白純化儀采用低溫有機溶劑沉淀法，使用如甲醇，乙醇等與水可混溶的有機溶劑，降低多數蛋白質的溶解度并且將其析出，和鹽析相比較，這種方法的分辨率更加的高，然而蛋白質比較容易變形，需要在低溫下進行。
蛋白純化儀還吸取按照分子大小不一樣的方法，在介質中對蛋白質離心時，蛋白質沉降速度取決于它的質量和密度，質量和密度越大，那么沉降越快；凝膠過濾（一種柱層析）；超過濾（利用蛋白質分子不能從半透膜通過的性質）。
GE_AKTA Pilot蛋白純化儀使用注意事項：
1.為了避免蛋白質變性，不要對樣品劇烈攪動和反復凍融。
2.緩沖溶液成分盡量模擬細胞內環。
3.在純化分離過程中，均必須時刻對它的穩定性注意維護，使它的活性得到保護，要注意避免蛋白質的氧化，避免重金屬對目標蛋白的破壞，避免微生物生長，避免蛋白酶對目標蛋白的降解。
4.盡可能置于冰上或者在冷庫內進行操作。
5.蛋白濃度不要太稀。
6.GE_AKTA Pilot蛋白純化儀除非是進行聚焦層，否則需要合適的pH環境，防止所使用的緩沖溶液pH與pI相同，使蛋白質的沉淀得以避免。
